凤凰颱风挟带丰沛雨量袭，造成各县市部分地区道路积水。疾病管制提醒民众，务必加强环境整顿，清除户内外积水容器，清理家园时应作好个人防护，注意饮食卫生，并做好「清除、清洁、消毒」防疫三步骤。
疾管副长周志浩指出，目前正值登革热流行季节，虽然本土登革热疫情集中于地区，但全都有登革热病媒蚊分布，各地也都有发生疫情的风险，民众应于灾后主动巡视居家环境，并清除户内外孳生源，如轮胎、铁铝罐、帆布、宝特瓶、盆栽垫盘等，降低社区病媒蚊密度，减少登革热病毒传播。
灾后清除积水勿赤脚。周志浩指出，灾后易产生污水、污泥或废弃物，清理家园时务必穿着雨鞋或防水长靴，配戴防水手套、口罩，避免被生鏽器物如铁钉、铁片等刺伤或割伤，以免感染钩端螺旋体病、类鼻疽、破伤风等传染病。
另外，周志浩提醒民众，家中有淹水，可购买市售含氯漂白水并稀释100倍，擦拭居家环境，厨具、餐具应煮沸消毒，或以10公升清水加40毫升漂白水稀释进行消毒；若蓄水池遭受污水侵入，应确实清洗消毒后再蓄水，并将水彻底煮沸后再饮用。
